Das Museum befindet sich im Kreuzgang des ehemaligen Dominikanerklosters aus dem 17. Jahrhundert.

Archäologische Abteilung
Diese Abteilung präsentiert Funde aus Ausgrabungen und Entdeckungen im Gebiet von San Daniele. Besonders hervorzuheben sind die Artefakte aus der Steinbruchnekropole aus dem 1. Jahrhundert n. Chr., darunter Keramik, Knochenwerkzeuge, Bronze- und Silberschmuck, Münzen und Glasobjekte. Auch Fundstücke aus römischen Villen, wie Amphoren, Ziegelbruchstücke und landwirtschaftliche Geräte, werden ausgestellt. Abteilung für Sakrale Kunst
Die Sammlung umfasst bedeutende Werke, darunter Steinskulpturen wie die Geburt Christi von Francesco da Milano und die Madonna del Carmine von Eugenio Pini aus dem 16. und 17. Jahrhundert. Unter den Polyptychen sticht der venezianische Altar aus vergoldetem und geschnitztem Holz von 1441 hervor, der Paolo di Amedeo und Michele Giambono zugeschrieben wird. Erwähnenswert ist auch die Beweinung Christi aus dem Jahr 1488, ein Werk des bayerischen Bildhauers Leonardo Thanner, der in der zweiten Hälfte des 15. Jahrhunderts in Friaul tätig war und für die Kirche von Fratta geschaffen wurde. Sie befand sich zwischen dem Monte di Pietà (1797–1920) und der Kirche Sant’Antonio (1920–1990), bis sie schließlich im Museum untergebracht wurde.
Jüdische Abteilung
Diese Abteilung bewahrt schriftliche und fotografische Dokumente der jüdischen Präsenz in San Daniele del Friuli vom 16. Jahrhundert bis in die ersten Jahrzehnte des 20. Jahrhunderts und stellt einen bedeutenden Teil der Ortsgeschichte dar. Die Gemeinde, die sich seit dem 16. Jahrhundert dauerhaft niedergelassen hatte, spielte eine wichtige Rolle im wirtschaftlichen und sozialen Leben der Stadt, insbesondere durch Pfandleihe und Handel. Im Laufe der Zeit trugen Familien wie die Nantua, Luzzatto und Gentilli zur Entwicklung der Region bei und lebten integriert in das städtische und soziale Gefüge. Nach Phasen der Vertreibung und Rückkehr schrumpfte die Gemeinde allmählich, bis sie schließlich mit den Zentren von Udine und Görz verschmolz. Der jüdische Friedhof aus dem 18. Jahrhundert ist das greifbarste Zeugnis einer langen, eng mit der Geschichte von San Daniele verwobenen Präsenz. Abteilung für Schenkungen
Die Sammlungen des Museums verdanken sich bedeutenden Schenkungen, die von tiefen Verbindungen zu San Daniele del Friuli erzählen. Von der Sammlung Giuseppe Vidonis mit Kunstwerken, Einrichtungsgegenständen und Objekten, die das Wohnumfeld des berühmten Gelehrten nachempfinden, über die Schenkung des Gießermeisters Erasmo Contardo mit Medaillen und Schatullen zu Ehren von Künstlern und Orten in Friaul bis hin zum Vermächtnis des Malers Giacinto Gattoli, der lebendige Ansichten der Region und Werke von großem historischem und künstlerischem Wert schuf: Diese vielfältige Sammlung bereichert das Museum und stärkt seine Rolle als Bewahrer des lokalen Gedächtnisses und der lokalen Kreativität.